French Journals

Use of dynamical models for treatment optimization in HIV infected patients : a sequential Bayesian analysis approach.

Prague M.

Published in :

In revision in French Statistical Society Journal

Abstract

The use of dynamic mechanistic models based on ordinary differential equations (ODE) has greatly improved the knowledge of the dynamics of HIV and of the immune system. Their flexibility for fitting data and prediction abilities make them a good tool for optimization of the design delivery and efficacy of new intervention in the HIV field. We present the problem of inference in ODE models with mixed effects on parameters. We introduce a Bayesian estimation procedure based on the maximization of the penalized likelihood and a normal approximation of posteriors, which is implemented in the software NIMROD. We investigate the impact of pooling different data by using a sequential bayesian analysis (SBA), which use posteriors of a previous study as new priors. We illustrate that the normal approximation of the posteriors, which constrains the shape of new priors, does not prevent from gains in computation times and accuracy of estimation. The illustration is from two clinical trials of combination of antiretroviral therapies (cART) : ALBI ANRS 070 and PUZZLE ANRS 104. This paper reproduces some unpublished work from my PhD thesis. It is an extension of my oral presentation on the same topic at the 47th Journées de Statistique organized by the French Statistical Society (SFdS) in Lille, France, 2015, when being awarded the Marie-Jeanne Laurent-Duhamel prize.

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[RN-2016-1]

Modèles mathématiques dynamiques pour la médecine personnalisée.

Thiébaut R., Prague M. and Commenges D.

Published in :

Medecine/Science ITMO Sante publique - 30(2) - 23-26 - 2014

Abstract

Une des conditions nécessaires à la mise en oeuvre d’une médecine personnalisée est l’obtention de prédictions individuelles de qualité. Outre l’obtention de mesures toujours plus nombreuses (données « -omiques »), la méthode d’analyse de données est également un élément potentiellement majeur. Nous présentons un exemple d’utilisation de modèles mathématiques dynamiques mécanistes utilisables pour l’adaptation des traitements antirétroviraux de patients infectés par le virus de l’immunodéficience humaine. L’intérêt de ce type d’approche est de construire un modèle sur des connaissances biologiques de l’interaction entre les différents marqueurs et permettre ainsi, potentiellement, une puissance prédictive accrue.

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 @article{thiebaut2014modèles, title={Modèles mathématiques dynamiques pour la médecine personnalisée}, author={Thi{\'e}baut, Rodolphe and Prague, M{\'e}lanie and Commenges, Daniel}, journal={m{\'e}decine/sciences}, volume={30}, pages={23--26}, year={2014}, publisher={{\'E}ditions EDK, Groupe EDP Sciences}}

Key words :

Médecine personnalisée; Modèle mathématiques; Vulgarisation

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[RN-2014-1]